Aunque puede surgir en la nasofaringe una variedad amplia de tumores malignos, solo el carcinoma de células escamosas se considera en esta discusión porque el manejo de los otros tipos varía considerablemente según la histología. Las subdivisiones del carcinoma de células escamosas en este sitio son las siguientes:

• Linfoepitelioma (tumor de Schminke).
• Tumores de células transicionales.
• Grado bien diferenciado a precariamente diferenciado.
• Variedad queratinizante o no queratinizante.

La presencia de queratina se ha relacionado con control local y supervivencia disminuidos.